1、测RNA浓度:
OD值较高,比较好。
A260/280在1.9-2.1之间,说明RNA纯度较好;小于1.9,说明蛋白质残留;大于2.1,说明RNA讲解或者DNA残留,可以跑胶看看。
A260/230大于2.0较好;小于2.0,说明盐离子,可能是RNA中有机试剂残留。
2、反转录为cDNA
用诺唯赞的反转录试剂盒,进行反转录得到模版后,进行稀释;
3、检验引物的特异性
(1)普通PCR
可以使用10μL的体系,30个循环即可。目的是节约模版和mix酶。
体系如下:
F 0.5 μL
R 0.5μL
cDNA 1μL
ddH2O 3μL
Mix 5μL
(2)跑胶
PCR片段小于200bp,制1.2%-1.5%的胶;大于500bp,制0.8%-1%的胶。
设置130V,跑30分钟。
根据胶图检查引物是否是特异性表达,如果不是,可以考虑重新设计引物。
4、荧光定量实验
注:荧光定量的酶需要避光。
首先,计算好试剂的用量,多计算10%的量,因为实验过程中会有损耗。将模版和水进行混合,引物和酶进行混合。
(注:千万不要将模版和酶进行混合,不然会影响酶。)
接着,在定量板上先标注好基因,防止点错孔。先点模版和水的混合液,在点引物和酶的混合液。
接着,使用离心机,离心3-5分钟,充分混合。
最后,上机。上机程序需要根据试剂公司提供的说明书来设置。
5、荧光定量结果解读
Ct值在20-30之间,定量分析最准确;
Ct值小于10,需要稀释模板后,重新进行实验;
Ct值在30-35之间,需要提高模板浓度或增大反应体积,以提高扩增效率;
Ct值大于35时,检测结果无法定量分析基因的表达量。