背景
我很早就知道mamba配置环境比较有用,但是一直没有实施,转折点是在配置Trinity的时候,conda实在是解析太慢了,而且很卡,最后还安装不上。没有办法,就转向了mamba,mamba作为解析依赖的手段确实是很快的
操作
conda activate base
conda install -n base -c conda-forge mamba
#在shell环境下配置这个东西
使用示例
mamba create -n rna_env -c conda-forge -c bioconda python=3.10 trinity fastqc salmon samtools
conda activate rna_env