By wangjing, 30 September, 2025
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​一、 示意图与结构绘制​

  1. ​Biorender​

    ​功能​​:专业级的生物医学示意图绘制工具,提供大量模板和图标。

    ​工具链接​​:https://www.biorender.com/

  2. ​IBS​

    ​功能​​:用于绘制基因、蛋白序列的结构示意图,展示域、位点等信息。

​工具链接​​:http://ibs.biocuckoo.org/

​二、 序列分析与可视化​

  1. ​WebLogo​

    ​功能​​:生成序列标识图(Sequence Logo),展示多序列比对中每个位点的氨基酸或碱基保守性。

​工具链接​​:https://weblogo.threeplusone.com/

  1. ​OmicShare 序列LOGO绘制​

    ​功能​​:同样用于绘制序列标识图,提供在线生成服务。

​工具链接​​:https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/seqlogo

  1. ​ESPript 3.0​

    ​功能​​:增强型的多序列比对结果可视化工具,可高亮显示保守位点和二级结构。

​工具链接​​:https://espript.ibcp.fr/ESPript/cgi-bin/ESPript.cgi

  1. ​MView​

    ​功能​​:将多序列比对的结果进行可视化,支持多种色彩方案和输出格式。

​工具链接​​:https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/mview/

  1. ​GSDS​

    ​功能​​:用于绘制基因结构域示意图,展示基因的外显子-内含子结构。

​工具链接​​:http://gsds.gao-lab.org/

​三、 进化分析​

  1. ​NGPhylogeny.fr​

    ​功能​​:一站式在线构建系统发育进化树,集成了多种比对和建树算法。

​工具链接​​:https://ngphylogeny.fr/

  1. ​iTOL​

    ​功能​​:功能极其强大的进化树​​可视化与注释​​工具,支持添加多种注释层(形状、颜色、柱状图等)。

​工具链接​​:https://itol.embl.de/

  1. ​EvolView​

    ​功能​​:另一个优秀的进化树在线注释和可视化平台,界面友好。

​工具链接​​:http://www.evolgenius.info/evolview/

​四、 互作网络与高级图表​

  1. ​STRING​

    ​功能​​:预测并可视化蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,功能强大。

​工具链接​​:https://cn.string-db.org/

  1. ​CIRCOS​

    ​功能​​:绘制圈图,用于展示基因组数据或其他跨染色体、跨样本的关联关系。

​工具链接​​:http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/

  1. ​OmicShare 桑基图绘制​

    ​功能​​:绘制桑基图,完美展示数据的流动、转化或比例关系。

​工具链接​​:https://www.omicshare.com/tools/home/report/report_sankey.html

  1. ​OmicShare 网络热图​

    ​功能​​:绘制网络热图,展示复杂的数据关系矩阵。

​工具链接​​:https://www.omicshare.com/tools