一、 示意图与结构绘制
Biorender
功能:专业级的生物医学示意图绘制工具,提供大量模板和图标。
工具链接:https://www.biorender.com/
IBS
功能:用于绘制基因、蛋白序列的结构示意图,展示域、位点等信息。

工具链接:http://ibs.biocuckoo.org/
二、 序列分析与可视化
WebLogo
功能:生成序列标识图(Sequence Logo),展示多序列比对中每个位点的氨基酸或碱基保守性。

工具链接:https://weblogo.threeplusone.com/
OmicShare 序列LOGO绘制
功能:同样用于绘制序列标识图,提供在线生成服务。

ESPript 3.0
功能:增强型的多序列比对结果可视化工具,可高亮显示保守位点和二级结构。

工具链接:https://espript.ibcp.fr/ESPript/cgi-bin/ESPript.cgi
MView
功能:将多序列比对的结果进行可视化,支持多种色彩方案和输出格式。

GSDS
功能:用于绘制基因结构域示意图,展示基因的外显子-内含子结构。

工具链接:http://gsds.gao-lab.org/
三、 进化分析
NGPhylogeny.fr
功能:一站式在线构建系统发育进化树,集成了多种比对和建树算法。

工具链接:https://ngphylogeny.fr/
iTOL
功能:功能极其强大的进化树可视化与注释工具,支持添加多种注释层(形状、颜色、柱状图等)。

工具链接:https://itol.embl.de/
EvolView
功能:另一个优秀的进化树在线注释和可视化平台,界面友好。

工具链接:http://www.evolgenius.info/evolview/
四、 互作网络与高级图表
STRING
功能:预测并可视化蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,功能强大。

工具链接:https://cn.string-db.org/
CIRCOS
功能:绘制圈图,用于展示基因组数据或其他跨染色体、跨样本的关联关系。

OmicShare 桑基图绘制
功能:绘制桑基图,完美展示数据的流动、转化或比例关系。

工具链接:https://www.omicshare.com/tools/home/report/report_sankey.html
OmicShare 网络热图
功能:绘制网络热图,展示复杂的数据关系矩阵。

工具链接:https://www.omicshare.com/tools