在测试数据库时发现了一个以前一直忽略的问题

在Drupal7的job page（Your Web address/admin/tripal/tripal_jobs）里会依据我们向后台发送执行内容的时间进行排序（以job name前的id区分先后关系）并且按照顺序执行，在默认条件下它只会一条接着一条进行Run，在正在有运行的Job时，就会无法执行后续的Job

例：在使用Tripal Data Loader上传GFF3文件时，这个Job所使用的时间很长，所以我在建六个BLAST库后进行测试BLAST时这个上传GFF3的Job仍然在占用Drush所以BLAST进行比对就会一直不出结果（一直停留在等待页面）。还以为是BLAST库的问题或者功能的问题，再去测试容器测试库以后可以正常比对，所以库是没问题的。

现在就意识到了可能是drush后台被占用的可能了，去搜索了一下平行多线程运行drush命令：

杜鹃花重测序数据质控及基因组变异检测软件下载方式整理

软件使用参考倩男师姐论文

问题： 

1、软件下载方式有在conda环境下载，有在ubuntu系统下载，有下拉镜像下载，导致我创了很多容器来分析数据，是否可以都下载到同一个容器中，是不是需要配置容器的环境？

 2、下拉的镜像中，如gatk镜像中，无法进行环境编辑，也无法下载tmux，如何解决？

# 可能存在的问题1 

## 首先确认phpPgAdmin是否可以链接到postgresql数据库：

方法：查看/var/lib/pgsql/9.6/data/pg_log下的log有没有phpPgAdmin的访问记录，有则说明可以链接。 查询后，显示如下内容：

如上图，添加链接时，如果是文件已经上传论坛的，则应该使用内部地址。

外部地址示意：http://tmp.fketech.com:8080/sites/default/files/users/user37/GAPIT-%E6%9D%9C%E9%B9%83%E8%8A%B1GWAS%E5%9F%BA%E6%9C%AC%E6%B5%81%E7%A8%8B.zip 

内部地址示意：/sites/default/files/users/user37/GAPIT-%E6%9D%9C%E9%B9%83%E8%8A%B1GWAS%E5%9F%BA%E6%9C%AC%E6%B5%81%E7%A8%8B.zip 

1. 表型组学的综述文献分享

一篇由华中农业大学发表在Molecular Plant上的综述性文章Crop Phenomics and High-Throughput Phenotyping: Past Decades, Current Challenges, and Future Perspectives，简述了过去几十年中表型组学的发展历程，并对现在的多组学研究和高通量表型与遗传学研究的结合研究做了详尽的分析，最后还提出了一些概念上的挑战以及关于如何弥合表型-基因型差距的观点，是近些年来对于表型组学研究情况和未来机遇挑战（攻关方向）分析的很透彻的一篇好综述。

主要是修改php.ini配置 

Php.ini文件一般在/usr/local/etc/php里面，如果没有最好是把php.ini-production文件改成php.ini 

php -v 查看php版本 

需要改的地方 

1、upload_max_filesize = 8M ;允许上传文件大小的最大值。默认为2M 

2、post_max_size = 10M 

3、max_file_uploads = 20

一定要记得重启apache / apachectl restart 

如果上传文件超过8M，要额外修改

 1、max_execution_time 600 默认值为30 

2、max_input_time 600 默认值为60

 3、memory_limit 8m 默认值为8