侃大山,随便聊聊。有啥新奇特的Idea都可以分享。
1. ingroup物种选择错误
ingroup需要填写感兴趣的物种;outgroup是研究的物种的外类群。但是,需要注意的是ingroup和outgroup不应该包含全部的物种。
2. Blast报错
# 报错的具体信息:
Error:(803.7)Blast-def-line-set.E.seqid.E.local.str
Bad char [0x9]in Visiblestring at byte 252该错误是由于物种的蛋白质序列文件出错所导致的,需要利用gffread根据基因组序列文件和注释文件重新生成蛋白质序列文件。但,并不清楚到底为什么下载的蛋白质序列文件会在makeblastdb这一步报错。
3. 基因ID不规范导致的报错