问题：

在运行命令的过程中，有时候会遇到无法判断运行时间的长短、突然断网以及不方便挂在后台等情况。这些情况都会导致任务中断，而screen命令能够很好的解决这一问题。利用ssh远程登录终端时，screen命令能够保证命令不因远程窗口的关闭而中断。

Screen命令：

在运行命令前，可以新建一个screen窗口，即创建一个虚拟终端，然后在该窗口里进行操作。后续因网络等问题导致窗口关闭或者自行退出后，也可以利用screen命令找回该命令，并且任务也能够正常运行。

问题：

在拉取Drupal8镜像之后，需要修改php的配置，但是发现找不到php配置文件
利用 find / '*php.ini*'  也无法搜索到

解决：

1. 首先在Drupal中，利用php的Status report查看php的具体信息：

     发现php的配置文件夹里面只有php扩展的一些配置文件，并且在php.ini的路径这显示为none。
     经查资料发现，可能是编译安装的php没有生成php.ini文件，一切配置信息都是默认的。而解决办法就是找到php源码包来获取php.ini-development文件并复制到配置路径下。

在测试数据库时发现了一个以前一直忽略的问题

在Drupal7的job page（Your Web address/admin/tripal/tripal_jobs）里会依据我们向后台发送执行内容的时间进行排序（以job name前的id区分先后关系）并且按照顺序执行，在默认条件下它只会一条接着一条进行Run，在正在有运行的Job时，就会无法执行后续的Job

例：在使用Tripal Data Loader上传GFF3文件时，这个Job所使用的时间很长，所以我在建六个BLAST库后进行测试BLAST时这个上传GFF3的Job仍然在占用Drush所以BLAST进行比对就会一直不出结果（一直停留在等待页面）。还以为是BLAST库的问题或者功能的问题，再去测试容器测试库以后可以正常比对，所以库是没问题的。

现在就意识到了可能是drush后台被占用的可能了，去搜索了一下平行多线程运行drush命令：

杜鹃花重测序数据质控及基因组变异检测软件下载方式整理

软件使用参考倩男师姐论文

问题： 

1、软件下载方式有在conda环境下载，有在ubuntu系统下载，有下拉镜像下载，导致我创了很多容器来分析数据，是否可以都下载到同一个容器中，是不是需要配置容器的环境？

 2、下拉的镜像中，如gatk镜像中，无法进行环境编辑，也无法下载tmux，如何解决？

# 可能存在的问题1 

## 首先确认phpPgAdmin是否可以链接到postgresql数据库：

方法：查看/var/lib/pgsql/9.6/data/pg_log下的log有没有phpPgAdmin的访问记录，有则说明可以链接。 查询后，显示如下内容：