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侃大山,随便聊聊。有啥新奇特的Idea都可以分享。

By ruiyuan Li, 31 July, 2025

表达基因聚类分析

• 进行 Mfuzz 聚类分析(假设已完成表达矩阵标准化)推荐使用 log2(TPM + 1) 或 log2(FPKM + 1) 的表达矩阵。
• 绘制聚类趋势图并保存为 PNG 图片
• 自动导出每一类基因列表到 txt 文件
• 自动统计每一类的基因数目,并保存为表格
根据需求修改输入和输出文件及文件夹位置

By wuzhenzhen, 11 July, 2025

背景:

为了解决网站的SQL注入的问题,直接在服务器上修改代码有点太麻烦了,所以选择在本地修改好后传到服务器上。因此,需要将服务器上的数据库打包成sql文件,重新传到电脑本地数据库上。但是在传到本地数据库这一步,遇到了报错。

报错1:

[SQL] Query fpkm_202507 start
[ERR] 2006 - MySQL server has gone away
[ERR] -- MariaDB dump 10.19  Distrib 10.4.27-MariaDB, for Linux (x86_64)

解决:经查找怀疑是max_allowed_packet参数有问题。因此,在数据库的配置文件my.ini中,找到该参数,发现默认值为1M。而自己导入的sql文件为300M。将参数修改为512M后,报错解决。

 

报错2:

上述问题解决后,传到第二个sql后缀文件时,又遇到了下述错误: