Description

如果有什么常用的资源,可以大家一起分享的,请在此处分享。

By zhenzixu, 30 June, 2025
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注:使用脚本在附件中

•main.py - 自动化流程控制 

•bmk_spatial_h5ad.py - 数据转换脚本 

将数据转换为Scanpy兼容的h5ad格式 

•S1000_Scanpy_v1.0.py - 可视化分析 

(1)预处理 ①展示在所有细胞中占比最高的基因的计数(top10); ②过滤;③标准化; ④识别高度多变的基因(top2000); ⑤利用回归模型消除不同细胞的counts之间的差异(测序导致) 

(2)聚类 

(3)差异分析(每个聚类top20)

By zhenzixu, 30 June, 2025
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1.在设定温度为25度,湿度为60%时,水箱耗水三-四天/一周内无明显变化,但是培养箱内香榧扦插苗存活情况不好 

2.后将湿度改为85%,此时水箱耗水为24小时左右一箱 

3.6.23左右发现湿度并不会持续维持在85%,耗水无明显变化 

注意: 

1.水箱灌满水后,放置时要与底座卡严

2.水箱要定期冲洗,长时间不冲洗会有污垢积累

其他待观察补充