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如果有什么需要合作、配合、寻求帮助的,在这里发布。

By Wuxiaopei0509_, 10 October, 2023
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首先构建hifi组装的容器 docker run -itd -v /data/wuxiaopei_93/pacbio:/home --name hifi ash123fhd/centos:7.6 /bin/bash 下载软件 wget https://github.com/chhylp123/hifiasm/archive/refs/tags/0.19.6.tar.gz 版本:Hifiasm-0.19.6-r595 docker exec -it hifi bash 2023/9/27第一次跑hifiasm,加了入hic数据 /Hifiasm/hifiasm-0.19.6/hifiasm -o TG_male.asm -t 72 --h1 TG_hicR1.fq.gz --h2 TG_hicR2.fq.gz TG_hifi_bam.fastq 2023/10/7 killed 找原因: 可能内存不足? 2023/10/9 加入-f38参数第二次跑 /Hifiasm/hifiasm-0.19.6/hifiasm -o TG2_male.asm -t50 -l0 -f38 --h1 TG_hicR1.fq.gz --h2 TG_hicR2.fq.gz TG_hifi_bam.fastq
By zaiai2011, 23 August, 2023
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存放地址镜像名称创建者创建时间用途
91 FTP服务器*1ubuntu20.04_vesci_zcj_20230823.tarZCJ20230823

vim, emacs, Blat, Scipio

为Augustus基因组注释需求部件。

     
     
备注*1 lftp:zhanglab:Zhaxxx14_@192.168.169.91可以登录,需要设置主被动模式。参考相关文档
By zaiai2011, 1 August, 2023
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服务器IP容器名称创建者外部访问链接及端口用途
168.169.92zcj_shadowzcj仅可校内校内代理访问服务器,可以直接输入容器IP访问。需要注意,系统重启后,容器IP会发生变化。
168.169.92GeneFusionzcjssh登录Griffin_Detector流程的测试容器,目前发布数据测试无误。
168.169.92Chimera-1zcj

http://tmp.fketech.com:7088/zaiai_fusion/