Description
工作流程发布,不足交流探讨及改进
工作流程发布,不足交流探讨及改进
1、打开计算反射率的spe文件
选择常用计算,植被指数,选择自己想要得到的参数。例如NDVI
选择文件,点击确认,保存为新的文件。
打开新的NDVI文件,进行分析。
点击position information,点击植物的叶片,生成数值。
使用软件HHIT,计算反射率
导入spe后缀的文件,先调高亮度,然后点击ROI
在反射板上圈出一部分,在ROI右键点击统计。
结果如下,得到计算结果后,最小化
使用mxscan软件以及在线网站呈现的是物种间所有基因的共线性。
利用tbtools软件可以呈现基因家族的共线性。
参考:
#安装软件
git clone https://github.com/wyp1125/MCScanX.git
cd MCScanX
apt update
apt install openjdk-11-jdk
make
#下载完了之后,会有示例数据
#检查示例数据的内容以及格式,将自己的文件修改为与示例格式一致
#示例数据介绍