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工作流程发布，不足交流探讨及改进

By Tingting, 30 July, 2025

根据染色体位置重命名基因家族

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由于使用睿远的发布的代码，但是会出现以下这种情况。

举例，原本基因名为evm.TU.PTG000033L.1 新的基因ID为TgSBT1。那么检测到evm.TU.PTG000033L.10这种也会替换将前面的evm.TU.PTG000033L.1的替换掉就变成TgSBT10。

于是，想了一个稍微笨一点方法。

首先是提取基因在染色体上的位置，通过excel排序生成一个包含老基因和新基因名的文件。再根据文件来进行替换。

1、先是生成染色体位置的文件

By Tingting, 27 July, 2025

仪器篇-双通道调制叶绿素荧光仪

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一、仪器介绍

可以测量Fluo和P700

测量前准备：将材料进行暗适应，20-30分钟。

测量时：需要在黑暗环境下，夹住叶片，每个测量时间为5分钟。

二、数据解读

1、基础荧光参数

（1）初始荧光F0

当所有光系统Ⅱ（PSⅡ）反应中心均处于开放状态时，叶绿素分子所发射出的最小荧光。它反映了叶绿素吸收光能但未被用于光合作用光化学反应时的能量耗散情况。

（2）最大荧光Fm

在所有PSⅡ反应中心都处于关闭状态时所测量到的最大荧光产量。这一数值与PSⅡ反应中心捕获光能的能力相关。

（3）可变荧光Fv

由公式Fv = Fm - F0计算得出。它代表了PSⅡ反应中心将吸收的光能转化为化学能的潜力。

2、光化学效率参数

（1）PSⅡ最大光化学量子产量（Fv/Fm）

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