Description
工作流程发布，不足交流探讨及改进
Forums
传统的RNA-seq可以用来分析全部基因在某个阶段的表达量，而新生转录组RNA-seq 则可以看到基因的表达是如何被调控的公众号原文链接：新生转录组 RNA 测序技术（Nascent RNA-seq）：从原理到应用的全景解析
Forums
1、打开计算反射率的spe文件
选择常用计算，植被指数，选择自己想要得到的参数。例如NDVI
选择文件，点击确认，保存为新的文件。
打开新的NDVI文件，进行分析。
点击position information，点击植物的叶片，生成数值。
Forums
Forums
使用软件HHIT，计算反射率
导入spe后缀的文件,先调高亮度，然后点击ROI
在反射板上圈出一部分，在ROI右键点击统计。
结果如下，得到计算结果后，最小化
Forums
使用mxscan软件以及在线网站呈现的是物种间所有基因的共线性。
利用tbtools软件可以呈现基因家族的共线性。
参考：
Forums
#安装软件
git clone https://github.com/wyp1125/MCScanX.git
cd MCScanX
apt update
apt install openjdk-11-jdk
make
#下载完了之后，会有示例数据
#检查示例数据的内容以及格式，将自己的文件修改为与示例格式一致
#示例数据介绍