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工作流程发布,不足交流探讨及改进

By wangchaoqiang, 22 September, 2024
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By fanbingbing, 19 September, 2024
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1.首先将航拍图和分区图导入PS,并对齐

2.使用多边形套索工具裁剪粉区,裁剪后混合有其他颜色,再次用多边形套索裁剪将其他颜色裁掉

3.ctrl c+ctrl v复制粘贴,然后进行分区,将1区进行多边形套索裁剪再复制粘贴创建新的图层

4.使用椭圆工具,颜色绿色,按住shift键进行画圆,调整⚪的大小

5.调整好后,在其他香榧点上直接点点即可,会出现和之前一样大小的圆,然后分别标序号

6.点好点后进行连线,使用铅笔工具,像素8,选中两个相邻的圆,按住shift键进行连接

7.选中基准点所在的图层,右击混合选项,描边,像素15,颜色白色

8.再添加标识、图例,粉1区就做好了

By Tingting, 16 September, 2024
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由于又对原文件进行处理,之前操作的步骤笔记记录的比较分散,所以整理汇总一部分。

 

文件:combine_all.pass.recode.clear.vcf

 一、删除突变位点(--snps-only),只保留染色体上的SNP(--chr 1-13)

plink --vcf combine_all.pass.recode.clear.vcf --snps-only --chr 1-13 --make-bed --out combine_all.pass.recode.clear.snp.only.13chr.vcf